BioNeMo amplia la biología digital para la industria biofarmacéutica y científica global

NVIDIA anunció hoy que líderes de la industria farmacéutica y tecnológica a nivel global, pioneros académicos e investigadores de IA están adoptando el marco de código abierto NVIDIA BioNeMo para colaborar y avanzar en el descubrimiento de nuevos fármacos, y acelerar el diseño de moléculas.  

“La convergencia de la IA, el procesamiento acelerado y la expansión de los conjuntos de datos ofrece oportunidades sin precedentes para la industria farmacéutica, como lo demuestran los recientes premios Nobel en química”, afirma Kimberly Powell, vicepresidenta de Atención Médica de NVIDIA. “Para ayudar a desentrañar las complejidades de los sistemas biológicos, presentamos el marco de código abierto BioNeMo, que permitirá a los investigadores de todo el mundo acelerar el desarrollo de tratamientos para salvar más vidas”. 

Los investigadores necesitan modelos biomoleculares especializados y conjuntos de datos que les permitan recopilar información a gran escala para diseñar tratamientos y medicamentos más rápido. El marco de trabajo de código abierto BioNeMo ofrece una colección de herramientas de procesamiento acelerado diseñadas para escalar exponencialmente los modelos de IA para la investigación biomolecular, lo que aporta un nuevo nivel de superprocesamiento a la industria biofarmacéutica. 

“Argonne ha aportado modelos biológicos de mil millones de parámetros que requieren de software especializado para entrenarlos en entornos informáticos de alto rendimiento”, afirma Arvind Ramanathan, líder del grupo de Ciencias Computacionales del Laboratorio Nacional Argonne. “Con BioNeMo, Argonne y la comunidad biotecnológica en general tienen una herramienta de código abierto a nivel empresarial que permite a los investigadores escalar fácilmente el entrenamiento de grandes modelos biológicos fundamentales, en laboratorios que de otro modo no tendrían la experiencia ni capacidad computacional para hacerlo”. 

“El framework de código abierto NVIDIA BioNeMo ayuda a los investigadores y empresas del sector sanitario a desarrollar de forma rápida y eficiente nuevos fármacos e incluso tratamientos que reduzcan los riesgos para los pacientes. NVIDIA está siempre a la vanguardia, proporcionando las herramientas necesarias para impulsar y colaborar con este sector”, afirma Marcio Aguiar, director de la división Enterprise de NVIDIA para Latinoamérica. 

Las empresas de biotecnología pioneras, investigadores de biotecnología, así como las compañías y organizaciones de plataformas de IA ya están contribuyendo o contribuirán al marco de código abierto, entre algunas de ellas se encuentran Alpha Bio, el Laboratorio Nacional Argonne, Dyno Therapeutics, Ginkgo Bioworks, Relation, VantAI y Weights & Biases. Los principales líderes de investigación conocidos por promover la ciencia computacional también están utilizando el marco BioNeMo para impulsar la innovación. 

Presentación de la plataforma de próxima generación BioNeMo 

La plataforma de extremo a extremo NVIDIA BioNeMo está diseñada para acelerar la creación, personalización e implementación de modelos de IA para el descubrimiento de fármacos, así como el diseño molecular. Se integra perfectamente con la infraestructura de procesamiento acelerado, reduce los costos, aumenta la escala y acelera los flujos de trabajo de descubrimiento de fármacos para proporcionar información rápida y confiable a partir de datos biomoleculares. 

Además del marco de trabajo BioNeMo, la plataforma es compatible con NVIDIA NIM (microservicios optimizados para la aplicación de IA segura y escalable) para BioNeMo y NVIDIA BioNeMo Blueprints, que son diseños de referencia optimizados para flujos de trabajo computacionales y de laboratorio.

NVIDIA también anunció una nueva colección de microservicios NIM optimizados y fáciles de usar para BioNeMo. Los microservicios se pueden implementar de manera rápida y sencilla en las instalaciones, en cualquier centro de datos e incluso a través de la nube. Esto ofrece a los desarrolladores la flexibilidad de ejecutar aplicaciones en una amplia gama de entornos y reduce el tiempo desde la inferencia hasta la obtención de información para la investigación de descubrimiento de fármacos biológicos. 

Los microservicios NIM disponibles admiten modelos líderes en la industria, incluidos: 

• AlphaFold2 es un modelo de aprendizaje profundo, desarrollado por Google DeepMind, diseñado para transformar la predicción de la estructura de las proteínas. Los investigadores que han utilizado el microservicio NIM AlphaFold2 para BioNeMo lograron una velocidad 5 veces mayor al predecir las estructuras de las proteínas casi en tiempo real. 
• DiffDock 2.0 se basa en la investigación del MIT y se entrenó en el conjunto de datos PLINDER. Con el microservicio NIM DiffDock 2.0, los investigadores pudieron predecir la orientación de una molécula 6.3 veces más rápido y con un 16% más de precisión. 
• Los microservicios NIM RFdiffusion y ProteinMPNN ayudan a acelerar el proceso de diseño de nuevas proteínas para que se unan a una molécula objetivo y permiten la creación de nuevos tratamientos proteicos.

BioNeMo ahora incluye nuevas bibliotecas de aceleración, incluida cuEquivariance, que acelera los cálculos matemáticos esenciales para las predicciones DiffDock para la química. 

Además, las empresas también pueden utilizar NVIDIA BioNeMo Blueprints, un catálogo de flujos de trabajo de IA de referencia personalizables, para ayudar a los desarrolladores a escalar sus implementaciones de IA como canales de producción de nivel empresarial. 
 
BioNeMo Blueprint para la detección virtual proporciona un flujo de trabajo personalizable y fácil de usar con microservicios NIM para diseñar más rápido moléculas pequeñas, al tiempo que se ahorran tiempo y costos. 

Más de 200 empresas tecnológicas, grandes farmacéuticas y startups ya están integrando BioNeMo en sus plataformas y flujos de trabajo de descubrimiento de fármacos asistidos por computadora. 

Finalmente, los integradores de sistemas globales, proveedores de software y proveedores de servicios en la nube como Accenture, AWS y Deloitte están llevando NVIDIA BioNeMo Blueprints a más empresas de todo el mundo. Para más información puedes visitar la Web Oficial o seguir las redes sociales oficiales como la Cuenta de Twitter.